Covid-19: a análise do genoma revelaria uma origem dupla do vírus

No espaço de algumas semanas, todos nós aprendemos muito, mas também ouvimos alguns rumores sobre a doença de Covid-19 e o vírus responsável: SARS-CoV-2. Embora o número de artigos científicos sobre este vírus continue a aumentar, ainda existem muitas áreas nebulosas quanto à sua origem.

Dque espécie animal apareceu? Um morcego, um pangolim ou alguma outra vida selvagem? De onde ele é ? De uma caverna ou floresta na província chinesa de Hubei ou em outro lugar? Em dezembro de 2019, 27 das primeiras 41 pessoas hospitalizadas (66%) passaram por um mercado localizado no coração da cidade de Wuhan, na província de Hubei. Mas a origem da epidemia provavelmente não está ligada aos contatos com animais vivos ou mortos presentes neste mercado, ao que parece, de acordo com um estudo chinês realizado no hospital de Wuhan, que o primeiro caso humano identificado não visitou este mercado.

De acordo com esta hipótese, o datação molecular estimados a partir das sequências genômicas de SARS-CoV-2 indicam uma origem em novembro. Portanto, temos o direito de nos perguntar sobre a ligação entre esta epidemia de Covid-19 e a vida selvagem.

O que sabemos de dados genômicos em Betacoronavírus

O genoma SARS-CoV-2 foi rapidamente sequenciado por pesquisadores chineses. É uma molécula deARN de cerca de 30 bases contendo 000 genes, incluindo o gene S que codifica para uma proteína localizada na superfície do envelope viral (para comparação, nosso genoma está na forma de uma dupla hélice de DNA com um tamanho de cerca de 15 bilhões de bases e contém quase 3 genes).

Análises genômicas comparativas mostraram que SARS-CoV-2 pertence ao grupo de Betacoronavírus e que está muito perto de SARS-CoV, responsável por uma epidemia de pneumonia aguda que apareceu em novembro de 2002 na província chinesa de Guangdong, que então se espalhou para 29 países, notadamente na França em 2003.

Um total de 8098 casos foram registrados, incluindo 774 mortes. Nós sabemos que morcegos do gênero Rhinolophus (potencialmente várias espécies de cavernas) foram o reservatório deste vírus e que um pequeno carnívoro, a civeta de palmeira (Paguma larvata), poderia ter servido comohospedeiro intermediário entre morcegos e primeiros casos humanos.

Desde então, muitos Betacoronavírus foram descobertos, principalmente em morcegos, mas também em humanos. É assim que o vírus RaTG13, isolado de um morcego da espécie Rhinolophus affinis coletado na província chinesa de Yunan, foi recentemente descrito como muito próximo ao SARS-CoV-2, o sequências de seu genoma sendo 96% idênticas. Esses resultados indicam que os morcegos, e em determinadas espécies do gênero Rhinolophus, constituem o reservatório dos vírus SARS-CoV e SARS-CoV-2.

Bastão, Rhinolophus affinis.
Alexandre Hassanin, Autor fornecida

Mas como você define um reservatório? Esta é uma ou mais espécies animais com pouca ou nenhuma sensibilidade ao vírus, que irão abrigar naturalmente um ou mais vírus. A ausência de sintomas da doença é explicada pela eficiência de seu sistema imunológico, que permite lutar contra a proliferação viral excessiva.

Mecanismo de recombinação

Em 7 de fevereiro de 2020, soubemos que um vírus ainda mais próximo do SARS-CoV-2 havia sido descoberto no pangolim. Com 99% de identidade anunciada, isso o tornava um reservatório mais provável do que os morcegos. Um estudo mais recente, atualmente em avaliação, sugere, no entanto, uma situação muito mais complexa. Finalmente, o genoma do coronavírus isolado do pangolim malaio (Manis javanica) não é, em geral, tão próximo do SARS-Cov-2, com apenas 90% de identidade. Ele, portanto, não é responsável pela epidemia atual.

Dito isto, o vírus isolado do pangolim exibe 99% de identidade com o SARS-Cov-2 se compararmos os 74 aminoácidos de uma região particular da proteína S, o domínio de ligação do receptor ACE2Enzima de conversão da angiotensina 2) que permite que o vírus entre nas células humanas para infectá-las. Na mesma região, o vírus RaTG13 isolado de morcegos R. affinis é muito divergente (77%).

Simplificando, isso significa que o coronavírus isolado do pangolim é capaz de entrar nas células humanas, enquanto o isolado dos morcegos R. affinis não é. Além disso, isso sugere que o vírus SARS-Cov-2 é o resultado de uma recombinação entre dois vírus diferentes, um próximo ao RaTG13 e outro próximo ao do pangolim. Em outras palavras, é uma quimera entre dois vírus pré-existentes.

Este mecanismo de recombinação teve já foi descrito em coronavírus, em particular para explicar a origem do SARS-Cov. É importante saber que a recombinação resulta em um novo vírus potencialmente capaz de infectar uma nova espécie de hospedeiro. Para que a recombinação ocorra, os dois vírus divergentes devem ter infectado o mesmo organismo concomitantemente.

Duas questões permanecem sem resposta: em qual organismo essa recombinação ocorreu? (morcego, pangolim ou outra espécie?) E sobretudo em que condições essa recombinação ocorreu?A Conversação

Alexandre Hassanin, Professor Associado (HDR) em biologia evolutiva na Sorbonne University, Museu Nacional de História Natural (MNHN)

Este artigo foi republicado a partir de A Conversação sob licença Creative Commons. Leia oartigo original.

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